الگوی rep-pcr استرین های pectobacterium جدا شده از سیب زمینی دارای علایم بیماری-های پوسیدگی نرم و ساق سیاه در استان همدان

استرین­های وابسته به باکتری جنس pectobacterium از مهم­ترین عوامل بیماری­زای گیاهی به­ویژه سیب­زمینی هستند. در استان همدان همه ساله گونه­های مختلف این باکتری زیان­های فراوانی را به بار می­آورند. از مناطق مختلف کشت سیب زمینی در استان همدان نمونه­های مشکوک و دارای علایم بیماری­های پوسیدگی نرم و ساق سیاه گردآوری و استرین­های باکتریایی مشابه pectobacterium رو ی محیط کشت emb جدا و خالص سازی شدند. پس از اثبات بیماری­زایی استرین­های باکتری روی سیب­زمینی، تعداد 27 استرین برای بررسی ویژگی­های فنوتیپی به­منظور شناسایی، انتخاب شدند. استرین­های باکتریایی مورد بررسی بر اساس ویژگی­های بیماری­زایی و فنوتیپی از هم­دیگر متمایز بودند. بر مبنای ویژگی­های فنوتیپی بیشتر استرین­های عامل بیماری سیب­زمینی به­عنوان pectobacterium carotovorum و تعدادی نیزpectobacterium atrosepticum شناسایی شدند. انگشت نگاری ﮊنومی استرین­های انتخاب شده به­روش rep-pcr  با استفاده از دو آغازگرeric  وbox  انجام شد. داده­های به دست آمده با استفاده از نرم­افزار ntsys v 2.2 و روش تجزیه خوشه­ای upgma آنالیز شد. نتایج حاصل نشان داد که استرین­های مورد آزمایش p. carotovorumو تعدادی نیز p. atrosepticum  هستند. بررسی الگوی  rep-pcrروشی سریع برای تشخیص و ردیابی استرین­های pectobacterium بیماریزای سیب­زمینی است.